De Twin Otter HP-1267APP van Aeroperlas vertrok op 17 maart 2000 om 08:46 van Aeropuerto Marcos A. Gelabert in Panama-Stad voor een lijnvlucht van ongeveer 55 minuten naar Puerto Obaldia1. De Twin Otter HP-1267APP van Aeroperlas verdween ongeveer 20 minuten voor de verwachte aankomst in Puerto Obaldia; de kruishoogte was 7500 voet1. Op 22 maart 2000 vond een zoekteam aan boord van de Cessna 208B Grand Caravan HP-1355APP het wrak van de Twin Otter HP-1267APP van Aeroperlas, 12.5 NM van Puerto Obaldia2. Het wrak van de Twin Otter HP-1267APP van Aeroperlas lag op 2500 voet hoogte op een berg van 2790 voet1.

Bij de crash van de Twin Otter HP-1267APP van Aeroperlas kwamen alle 2 bemanningsleden en alle 8 passagiers om1. PlaneCrashInfo meldt voor de Twin Otter HP-1267APP van Aeroperlas 10 inzittenden, 8 passagiers en 2 bemanningsleden, van wie niemand het overleefde3.

Volgens PlaneCrashInfo vloog de Twin Otter HP-1267APP van Aeroperlas 15 mijl voor de bestemming tegen een beboste berghelling en was het weer op dat moment slecht3. Aviation Safety Network meldt dat de weersomstandigheden op de route van de Twin Otter HP-1267APP van Aeroperlas VFR-vliegen toelieten; een oorzaak staat er niet bij1.

Na de verdwijning van de Twin Otter HP-1267APP van Aeroperlas werd eerst gedacht dat het toestel naar Colombia was gekaapt1. De Twin Otter HP-1267APP van Aeroperlas had serienummer 624, maakte zijn eerste vlucht op 15 mei 1979 en had twee Pratt & Whitney Canada PT6A-27-motoren1. De Engelstalige Wikipedia noemt de crash van de Twin Otter HP-1267APP bij Puerto Obaldia, Guna Yala, in het overzicht van ongevallen van Aeroperlas2.